全脑开发涵盖了三个层次，包括“IQ脑”、“EQ脑”以及“MQ脑”。
IQ （智商）
IQ脑主要负责人的学习、记忆、理解、判断和创造等，是属于能力方面的层次。
EQ （情商）
EQ脑主要掌控人的情绪及个性。一个人是否乐观、开朗、主动，都与EQ息息相关。
MQ （道德智商）
MQ脑主导一个人的人格。MQ的内容包括了体贴、尊重、容忍、宽恕、诚实、合作、负责、勇敢、和平、忠心、礼貌、 独立、幽默等各种美德，所以称之为道德智商。人的一切思想、观念、态度都与MQ有关，有好的MQ，其人格会趋向正面、光明，具备信心、勇气和智能，这些属于内在的表现，会影响到EQ，而EQ亦会影响到IQ，三者环环相扣。
根据全脑开发理论，一个人改变习惯分为强制、不自觉、自觉三个阶段，只要坚持到最后，建成良好的习惯是不成问题的。用到学习上，刚开始运用右脑思维和记忆觉得不大习惯，渐渐就会好转的，爱因斯坦说：“我思考问题时不是用语言进行思考，而是用活动的、跳跃的形象进行思考”。
